molar dempningskoeffisienten ved absorpsjonstoppen AV YOYO-1 er nesten 105 cm−1M−1, blant de høye verdiene av typiske organiske fargestoffer. Fluorescenskvantumutbyttet AV YOYO-1 i vann er svært lite (< 0,1%) og dermed ikke-fluorescerende. Ved binding TIL DNA øker kvanteutbyttet >1000 ganger og når opp til 50%, blant de lyseste fluorescerende organiske fargene. under lyseksitasjon observeres fotoblinking og fotobleking FOR YOYO – 1 I DNA. Sistnevnte er også antatt å være årsaken til photocleavage av verten DNA molekyler ved å generere reaktive frie radikaler.To hovedmekanismer har blitt foreslått i litteraturen for å forklare hvorfor YOYO-1 ikke er fluorescerende i de polare løsningsmidlene, men er fluorescerende når de interkaleres i DNA-baseparene. Den første er intramolekylær ladningsoverføring og den andre er intermolekylær ladningsoverføring. Begge er fortsatt aktivt under undersøkelse på hvilken som dominerer.den intramolekylære ladningsoverføringsmekanismen ble etablert rundt 1980-tallet. Under lysbelysning i vann skifter den eksiterte elektronen i molekylet sin sannsynlighet over metin-gruppen som gjør at molekylet kan rotere sammen med metin-gruppen, en fotoisomeriseringsreaksjon. Denne rotasjonen slapper av energien ikke-radiativt, slik at molekylet ikke er fluorescerende. MEN NÅR YOYO-1 blir interkalert i DNA-baseparene, blir det fast og kan ikke rotere. Dermed forblir molekylet fluorescerende. den intermolekylære ladningsoverføringsmekanismen ble foreslått i 2018. YOYO-1 er svakt bundet med de polare løsningsmiddelmolekylene. Når det er begeistret av lys, opprettes et elektronhullspar i molekylet. Hullet er i stand til å få en ekstra elektron fra løsningsmidlet som skapte et negativt ladet YOYO-1 radikal og et positivt ladet radikal i løsningen. Mest tid radikalet nøytraliserer hverandre veldig raskt og ikke-radiativt. Dette Er En Dexter-elektronoverføringsprosess som slukker fluorescensen og skaper rotasjonen AV YOYO-1-molekylet. Som sådan er rotasjonen et produkt av slokkingen, ikke årsaken til slokkingen foreslått i den intramolekylære ladningsoverføringsmekanismen. Det er liten sannsynlighet for at radikalene skiller hverandre og diffunderer bort, noe som gjør YOYO-1-molekylet mottakelig for fotobleking. NÅR YOYO-1-molekylene blir interkalert I DNA-molekylet, reduserer de hydrofobe baseparene kraftig den radikale formasjonen fordi DNA er en dårlig elektrisk leder. Dermed blir fluorescerende slukking av løsningsmidlet sterkt redusert. Det lille antallet lekkende ladninger skaper langlivede radikaler og kutter DNA-ryggraden som resulterer i EN DNA-fotocleavage. Denne mekanismen har blitt støttet av dataene i femtosekund ultrafast transient absorpsjonsspektroskopi.hvis den intramolekylære ladningsoverføringsmekanismen dominerer fluorescerende slukking AV YOYO-1 i vann, kan man legge til store ligand for å stoppe eller senke rotasjonen for å øke kvanteutbyttet i vann. Men hvis den intermolekylære ladningsoverføringen dominerer, kan man modifisere molekylet for å stoppe ladningsoverføringen MELLOM YOYO-1 og vann, enten ved ladningspassivasjon eller ligandmodifisering for å skifte redokspotensialene.